МНОГОФАКТОРНОЕ СНИЖЕНИЕ РАЗМЕРНОСТИ (MDR-АНАЛИЗ) В ГЕНЕТИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЯХ
Аннотация и ключевые слова
Аннотация (русский):
Исходя из предположения, что некоторые варианты генов в комбинации могут проявлять кумулятивный или эпистатический эффект, является актуальным изучение сочетания генотипов независимо действующих и взаимодействующих полиморфных генов. В статье описано применение непараметрического метода снижения мультифакторной размерности (MDR, Multifactor Dimensionality Reduction) на когорте высококвалифицированных спортсменов с целью определения наиболее предпочтительного сочетания генотипов генов нейромедиаторных систем, определяющих функционирование высшей нервной системы. На основе полученных данных о моделях межгенных взаимодействий проведен кластерный анализ, показывающий характер взаимодействия между полиморфными локусами генов нейротрансмиттерных систем. Кроме того, нами получены модели наиболее благоприятного сочетания генотипов для циклических и ациклических видов спорта. Метод MDR в наших исследованиях был также применён для выявления неблагоприятного сочетания генотипов в развитии таких патологий ка нефропатия и нарушение ремоделирования косной ткани у юных спортсменов.

Ключевые слова:
генетика, генетические исследования, анализ данных, биоинформатика, статистика, межгенные взаимодействия.
Список литературы

1. Ковалевич А., Падутов В., Баранов О. Полногеномное секвенирование-новый этап генетических исследований // Наука и инновации. – 2015. – №. 5(147). EDN: https://elibrary.ru/tzfqqx

2. Motsinger A. Multifactor dimensionality reduction: an analysis strategy for modelling and detecting gene-gene interactions in human genetics and pharmacogenomics studies. Human Genomics. 2007. Vol.2. No.5. P. 318-328. DOI: https://doi.org/10.1186/1479-7364-2-5-318

3. Пономаренко И.В. Использование метода Multifactor Dimensionality Reduction (MDR) и его модификаций для анализа ген-генных и генно-средовых взаимодействий при генетико-эпидемиологических исследованиях (обзор) // Научные результаты биомедицинских исследований. 2019. Т.5, № 1. С. 4-21. EDN: https://elibrary.ru/umbgkq

4. Multifactor Dimensionality Reduction [Электронный ресурс] 24.12.2014. – Режим доступа: https://sourceforge.net/projects/mdr/ – Дата доступа: 05.11.2024.

5. Шепелевич Н.В., Маринич В.В., Мельнов С.Б. Генетические маркеры нейромедиаторов и психофизиологические особенности квалифицированных спортсменов различных видов спорта //Прикладная спортивная наука. – 2024. – Т. 1. – №. 19. – С. 47-54. URL: https://rep.polessu.by/handle/123456789/31678

6. Жур Н. В., Лебедь Т. Л., Кручинский Н. Г. Применение анализа генетических исследований для диагностики и профилактики нефрологических осложнений у пациентов с сахарным диабетом второго типа // Здоровье для всех: научно-практический журнал. – 2023. – №. 1. – С. 28-36. URL: https://rep.polessu.by/handle/123456789/29037

7. Жур Н. В., Евдолюк С.В., Лебедь Т.Л., Маринич Т.В., Кручинский, Н.Г. Молекулярно-генетические методы в диагностике и прогнозировании индивидуальной предрасположенности к нарушению минеральной плотности костной ткани // Вестник Полесского государственного университета. Серия природоведческих наук. – 2024. – №. 1. – С. 66-72. URL: https://rep.polessu.by/handle/123456789/31760

8. Иванюкович В.А., Николаенко Е.А., Мельнов С.Б., Жур Н.В., Лебедь Т.Л. Влияние классификации исходов на результат моделирования и прогнозирования методом MDR // Сахаровские чтения 2023 года: экологические проблемы XXI века : материалы 23-й Международной научной конференции, Минск, Республика Беларусь, 18-19 мая 2023 г / Международный государственный экологический ин-т им. А.Д. Сахарова Белорусского государственного ун-та - Минск : МГЭИ им. А.Д. Сахарова БГУ, 2023. – Ч. 2. – С. 301-305. URL: https://rep.polessu.by/handle/123456789/28924

Войти или Создать
* Забыли пароль?